Para recusar, acesse Compras > Notas Fiscais de Entrada, pesquise pelo número da NF-e importada e clique nela. Em seguida, vá em Ações > Manifestar NFe, selecione a opção “Operação não realizada” e informe uma justificativa.
Note que a SEFAZ normalmente só permite recusa até 90 dias após a emissão, então a SEFAZ pode não aceitar o pedido de recusa.