Na tela de listagem, em Financeiro > Lançamentos:
pesquise e selecione os lançamentos desejados;
abra o menu Ações;
clique em Quitar Selecionados;
informe a data de pagamento;
se quiser, escolha uma conta para aplicar;
confirme a quitação.
Se houver mais de um lançamento, o sistema também permite usar datas diferentes para cada item.