Após o evento de confirmação da operação, a NF-e deixa de ser passível de cancelamento pelo destinatário no mesmo contexto informado na tela. Por isso, manifeste somente quando tiver certeza de que a nota realmente pertence à sua empresa e deve ser escriturada.
Você consegue ver os detalhes e importar a NF-e após o evento de Ciência da Operação, então o ideal é utilizar ele quando você ainda não conseguiu ter acesso à NF-e. E somente utilizar a Confirmação da Operação quando tiver conferido a nota.